Direi che con il parabrezza hai risolto egregiamente!

Per la carrozzeria, di solito dopo il primer io dò un paio di mani di vernice (una leggera e una più decisa), ma dipende da quanto è coprente il colore... Nel tuo caso, se sei soddisfatto va bene così!
Per le decal: premesso che non sono un grandissimo esperto di auto molto decalizzate... Credo che ciascuno trovi il suo metodo migliore come ordine di assemblaggio... Non ho mai affrontato questo kit, quindi non saprei cosa consigliarti.
Se la vernice sotto ha finitura abbastanza lucida, secondo me ci puoi mettere direttamente le decal senza dare prima il trasparente.
Al limite il trasparente lo potresti dare dopo, a decal posate (quindi in questo caso prima vanno messe le decal, dato trasparente e alla fine montate fanaleria e vetri), ma questo è un tema ampiamente trattato e discusso in molti altri topic del forum... Qualcuno che ha già affrontato il problema "decal sotto trasparente" può senz'altro darti pareri migliori dei miei!

Trattamenti sulle decal prima di piazzarle non mi risulta vadano fatti...